handbrake 再生できない時があります。

OS WinXpPro handbrake 0.9.4 で video-ts → h264 にする際にプリセットを一通り試したのですが、どうも4GB程度以上のサイズに仕上がったファイルが再生できないのです。拡張子を変えてみても、VLCメディアプレイヤー、iTunesともに再生出来ませんでした。何か心当たりがあれば教えていただけないでしょうか。